用人单位微信转账发工资，存在以下法律风险：1、证据链风险：若公司仅以微信转账发工资，未提供工资条等凭证，员工日后就工资数额、支付时间等与公司产生争议时，可能因证据不足维权困难。比如员工主张公司未足额支付工资，仅有微信转账记录，无法清晰证明金额对应的工资构成及扣除项，难以准确认定工资支付事实。2、核心权利影响风险：部分公司可能借微信转账逃避社保缴纳和个税代扣义务。例如，公司实际以现金或微信转账支付较高工资，但社保缴费基数申报时却按较低标准填写，损害员工社保权益，也可能影响个人税收申报记录。
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关于用人单位微信转账发工资是否违法，需依据《中华人民共和国劳动合同法》（2012年修正）第三十条分析：该条款规定“用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。拖欠或未足额支付的，劳动者可申请支付令”。法条强调及时足额支付，未绝对禁止微信转账。若公司微信转账符合劳动合同约定且及时足额支付，则不违法；反之，即使未及时足额支付，使用微信转账也属违法。
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用人单位微信转账发工资是否违法，需结合具体情况判断：-若劳动合同明确约定微信转账为工资支付方式，且公司能提供合法工资凭证（如工资条），并及时足额支付，则不违法。-若劳动合同约定非微信转账方式，公司未协商一致擅自变更，涉嫌违反劳动合同约定。-若公司借微信转账逃避税收、社保缴费等法定义务，该行为违法。
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用人单位微信转账发工资，特殊情况或例外情形可能影响其合法性：1、双方协商一致变更支付方式：若原约定非微信转账，但双方协商一致（书面或口头）变更并实际履行，微信转账合法有效。2、微信转账记录丢失：若因手机故障、误删导致转账记录无法恢复，公司又未提供其他工资凭证，员工维权时因证据不足可能处于不利地位。3、农民工等特殊群体支付：建筑领域农民工等特殊群体，根据规定应实名制管理并通过银行转账支付工资。用人单位对农民工采用微信转账，可能违反专项规定，构成违法支付。

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